有学者指出，五都选举的结果将使得马英九在未来两年专注于推动经济，而暂停两岸政治对话。
11月29号，台湾政治大学安全研究中心针对五都选举之后两岸关系以及台湾国际空间将如何发展，召开座谈会。
*民意希望两岸与国际并重*
淡江大学美洲研究所的詹满容教授认为，从选举结果中可看出民进党已经向中间选民靠拢，在经济议题上也采取较为开放态度。
政治大学国际关系研究中心的郑端耀博士则认为，五都选举国民党拿下三都，不过从得票率来看，马政府也有需要警惕的地方。他说：“考虑到马政府对中国大陆太过关注，并且与北京太靠近，那些感到不舒服的人所希望的，是看到更平衡的做法。所以或许我们这次看到许多票投给民进党，就是试着向马政府传达这个讯息，要在两岸关系与国际关系之间，看到更平衡的做法，更平衡的政策。”
*马英九能否出席明年亚太经合会?*
台湾欧洲联盟中心副主任甘逸骅提到，五都选举之后，从对于导弹的处置，或是明年马英九总统能不能出席在美国举办的APEC领袖会议，可以探测北京对马政府的态度。
政治大学美欧研究所所长刘复国认为，北京如果真的释出善意，对于马英九竞选连任会有帮助。他说：“在2011年，也就是明年，当亚太经合会的非正式领袖会议在火奴鲁鲁召开时，我们希望美国与中国能够和台湾紧密合作，而可以看到胡锦涛主席与马英九总统会面。如果这样的事情发生了的话，我想美国与中国都对于台湾的发展以及两岸关系作出了正面的贡献。”
*马英九两岸政策将主推经济避谈政治*
虽然本次五都选举两党都不将两岸关系当成竞选主轴，但许多与中国相关的议题依旧持续浮现，如东京影展上台湾电影代表团遭中国代表团要求承认一个中国，或是选前才发生的亚运跆拳道失格事件，都引发台湾人民对于中国的愤怒，也引起两岸人民互相指责，彰显了两岸人民的互不信任。
詹满容认为ECFA的签署，象征两岸关系的正常化，而这样的正常化对于解决两岸争议，是有好处的。她同时认为，“一个中国”已经是许多国际组织的“游戏规则”，台湾必须遵守游戏规则。台湾可以尽力去改变这规则，但人们不应抱持过高的期望。
刘复国指出，胡锦涛和马英九都表示过先经济后政治的立场，但由于上述的那些状况会不断发生，将迫使两岸进行对谈，但在2012年总统大选之前只会有经济方面对话，因为如果马英九进行政治对话，那就无法当选总统。
他说：“在选举之前，对于双方都是几乎不可能碰触这特定的议题，但是在选举之后，正如我之前说的，马总统将发现他的政府面临极大的压力，他必须有所行动。我不是说他会马上碰触政治议题，但至少他必须要确认这些议题能够被研究，然后能够被双方深入对谈。”
刘复国认为，发生冲突之后，不能只是两岸互相放话，必须要建立正常的机制来解决纷争。
