台湾中央流行疫情指挥中心星期五（3月13日）表示，第二梯次从武汉专机返台的361人所做的新冠病毒检验全部呈阴性，所有人全都状况正常，是否进行第二次的检验还有待进一步评估。这个检测结果对台湾一直严密进行的疫情防控而言是个好消息。
这361名旅客由台湾的中华航空以及中国大陆的东方航空，先后在10日深夜与11日凌晨从武汉抵达台湾，下机后分别送到3处检疫所隔离14天。目前他们的检验结果全为阴性，而且都没有发烧等不适现象。
中央流行疫情指挥中心正在考虑是否在他们结束隔离前再进行第二次的检验。
这批武汉专机返台旅客在检疫所内一人居住一室，不能外出。每人每天必须量体温两次，如果有发烧，呼吸道症状或身体不适，立即依照规定送去就医。检疫所也为工作人员提供了相关的防护装备。
台湾的联合报星期五报道说，由于两岸对防疫认识有差距，沟通过程波折，导致回台时间延迟，最后能顺利回台的人数也少了百名左右。
台湾TVBS报道，只有没有发烧的人才准许登上这两架返台包机。据估计目前还有1329名台湾人仍然滞留在湖北省。
第一批武汉包机于2月3日返台，之后两岸就在应由哪一方派出包机以及检疫问题争执不下，两岸协商过程难以进展，包机迟迟难以成行导致台商家属进行抗议，还有台商扬言告台湾政府违宪。
