台湾总统蔡英文11日透过脸书表示，没有政治考量，只有防疫考量，这是台湾政府始终坚持的原则。
蔡英文还指出，接回滞留在湖北的台湾民众，从前置协商、现场工作，一直到回台检疫措施，由于两岸双方对于防护标准的认知落差和不同作为，在实际执行的过程当中，都显得一波三折。
蔡英文强调，在防疫优先、弱势优先的原则下，经历许多的努力及协调，终于经由第二批包机载回了361位台湾民众及其家属。
台湾在野党国民党新科主席江启臣表示，所有包机必须做好完善准备，过程当中应该尊重专业、对等互惠，不要让政治阻碍了返乡之路。
两岸2月3日执行第一班包机之后，由于出现1名新冠病毒确诊病例，再加上双方对于搭乘人士的优先顺序有意见，因此直到本月10日才执行第二批包机，其间曾经引发滞留湖北台湾民众的不满。
