2001年9月11日，基地组织劫持两架飞机撞击了世贸中心。布什总统立即清楚地表明了他的态度：“昨天那场针对我们国家的蓄意袭击不只是恐怖行为，而且是战争行为。”
那项严厉声明引发了一些具有争议的新政策的出台。新政策把恐怖分子嫌疑人从本国和外国抓来关进一个合法的隐秘地点，而他们既不是战俘，也不是刑事被告，而被称为“非法的敌方作战人员”。
很多人被带到美军在古巴关塔那摩湾的基地，不享受在美国民事法庭就被拘留提出异议的人身保护权。
即使审判这些嫌疑人，也是在一个军事委员会进行，而他们在那里比在一般法庭受到的法律保护要少。
*采取不同的法律标准*
前司法部副助理部长约翰.余是布什政府囚犯政策的主要制定者。他说，战时情况要求对恐怖分子嫌疑人采取不同的法律标准。“有人提出，关塔那摩湾的囚犯或所有敌方作战人员都应该有律师，都应该享有人身保护权，那其实是一种把民法概念用于军事体系的做法。”
尤金.菲德尔是一名律师，也是全国军事审判研究所所长。他说，恐怖主义是一种犯罪，处理方式应当同其他形式的犯罪一样。“我个人的看法是，地区法庭，联邦法庭，都是我们司法体系皇冠上的珠宝。我们不应当依赖任何其他法律体系。我认为，军事委员会就像皇冠上的装饰性人造珠宝。而当你有货真价实的珠宝时，为什么要用人造的？”
对恐怖分子嫌疑人的审讯问题引发了激烈的争论，争论焦点是什么做法构成酷刑。大卫.里夫金曾任职于里根和老布什政府的司法部。他同意政府的说法，即美国没有对囚犯使用酷刑，不过他争辩说，审讯人员应当有一定的活动余地。
*虐囚不是政府政策*
布雷特.米库律师是关塔那摩湾一些囚犯的法律代表。他说他的一些委托人被转送到关塔那磨湾之前在阿富汗的美国拘留设施里受到过酷刑，比如被关在黑屋子里，连续几天戴镣铐，震耳欲聋的音乐昼夜不停，等等。
约翰.余承认，的确有囚犯受到虐待，但他坚持说，这不是政府的政策。
不论事实真相如何，菲德尔说，人们对美国囚犯政策的看法使美国政府在批评别国人权状况时不再那么理直气壮了。“我们确实喜欢在我们认为别人做错的时候教训别人，但我们要检查自己。如果我们的行为经不起检验，我们就必须转换口气。”
围绕拘留和处理恐怖分子嫌疑人的问题，持不同意见的人仍在法庭上较量。但正如约翰.余所指出的，布什政府在一些持怀疑态度的法官手里遭受了挫折。
