沉默一段时间后中国政府终于在星期三确认，台湾非政府组织、民主活动人士李明哲“因涉嫌从事危害国家安全活动”被拘留，人权组织和观察人士担忧中国正在扩大对NGO活动人士的攻击，希望当局对李明哲受到的指控提供进一步细节，否则就应立即将他释放。
目前在台北文山社区大学工作的李明哲自3月19日从澳门入境中国大陆后就失去音讯，他的家属、同事和台湾政府多次向中国政府询问都未获回音，星期三，中国国台办发言人马晓光在例行记者会上证实，李明哲因涉嫌从事危害国家安全活动正接受相关部门调查。
国际特赦组织(Amnesty International)东亚部主任林伟（Nicholas Bequelin）星期三在一个声明中指出，中国当局对李明哲有关“涉嫌从事危害国家安全活动”的指控过于空泛，这可能引发对中国是否正在扩大对合法NGO活动人士攻击的担忧，如果李明哲遭拘留“只是单纯与他的合法活动(legitimate activism)有关”，那么当局应该立即、无条件将他释放。
林伟说，李明哲因定义不明的“国家安全”理由被拘留，将使那些与中国境内NGO合作的人产生警惕，因为“当局现在针对NGO及它们合作伙伴所具有的不受监督权力，已经大到令人害怕的程度。”
美国时政评论人士史凯文(Kevin Slaten)在接受美国之音采访时说，从李明哲和最近几个与中国“危害国家安全”有关的案例，例如瑞典人权工作者彼得·达林（Peter Dahlin）、澳大利亚学者冯崇义等境外人士被抓捕或限制离境的情况来看，中国正在扩大国家安全的范围和定义，尽管一般境外普通民间人士到中国只是开会而非搞活动或抗议，都有可能被认为是触及国家安全的范围。
史凯文猜测，李明哲被抓可能有3个原因，第一个就是李明哲的背景。他说，客观而言，李明哲并非一般台湾公民，而是一个“关心中国民主”的台湾人，他是一个NGO工作者，而且还是前民进党党工，因此对中国而言，李明哲是一个“有政治色彩背景”的台湾人。其次可能与中国年初开始实施的《境外非政府组织境内活动管理办法》有关
史凯文说：“这个法也是中国公安部管理的，公安部是国家安全的管辖权，有可能他是因为这个原因被抓的；第3，最近新闻报道说李明哲跟中国大陆很多NGO有交流，我们不知道他到底和哪些NGO和人士交流，有可能是比较敏感和所谓的敏感人士，有可能是跟他们的案子有关。”
对于台海两岸目前官方交流中断的情况下，台湾应该如何在李明哲案施力或协助家属，史凯文认为，单方面施压较为困难，台湾政府应该透过国际社会发声，让北京知道人权是普世价值，任意抓捕公民是非法的。
史凯文说：“单方面施压中国很难，但是这应该变成一个国际社会的问题。总体来说，国际社会重视民主，重视民间社会、公民社会。基于这些原则，还有人权的普世价值，整个国际社会应该强调，你这样抓捕人是不对的，按照国际法是非法的，台湾政府可能只能基于这些倡导或行动去帮助李明哲。”
此为，史凯文也表示，中国国内有其法律程序，或许有人权律师愿意协助如今自己都成为敏感人士的李明哲，不过他说，“这种法律程序都是假的”，最后是否能真正帮到李明哲他感到悲观。
台湾“关怀中国人权联盟”理事长杨宪宏告诉美国之音，李明哲在台湾经常参与关心中国民主运动的活动，他所做的事在全球民主世界，包括台湾，都合乎情理法，但只有在中国会被抓。
杨宪宏说，如果中共认为这是境外反华势力入侵，那么两岸关系“根本走不下去”，因为李明哲是坚持民主自由价值的2千3百万台湾人其中一个，抓一个李明哲等于告诉全台湾人，中共是与台湾价值和全球价值为敌，因此他说，“习近平不下令放人，就是首恶。”
