香港特首梁振英等港府官员，星期三上午通过媒体，向外界通报香港官员星期二赴京与内地相关部门磋商两地通报机制的成果。而对媒体关注的港府是否会按照内地所言将踢爆“被失踪”内情的铜锣湾书店店长林荣基送回内地，港府官员给与否定的答复。警务处官员同时表示，鉴于林荣基感到人身安全威胁，如果林荣基本人愿意，会提供人身保护。
香港特首梁振英和律政司司长袁国强、保安局长黎栋国、署理警务处长黄志雄，7月6日上午举行约20分钟记者会，通报港府官员星期二与公安部牵头的相关部门官员协商改进两地通报机制的成果。梁振英表示，两地官员同意，将通报时间压缩到少于十四日，覆盖所有执法单位，并提供明确的案情摘要。双方月底举行第二轮磋商。
不过，媒体对两地官员就通报机制磋商的成果似乎兴趣不大。由于宁波公安局在两地官员磋商前发布新闻稿，指如果铜锣湾书店店长林荣基违反“取保候审”规定，拒绝返回内地接受调查，将对他依法变更刑事强制措施。而且。人民日报海外版星期三发表评论，称公安机关与港警执法合作会更加密切，不要以为逃到香港就可以逃脱法律制裁，作出威胁口吻，因此媒体更关注港府是否会应允内地公安的要求，将林荣基送回内地。
尽管港府官员此前多次强调两地没有引渡机制，不过保安局长黎栋国不得不重申，根据基本法，只是列入附件三的内地法律在香港才有效力，所以，内地实施所有刑事强制措施，在香港没有法律效力，且香港与内地没有引渡安排，香港执法人员必须根据香港的法例执法。
在被问到在北京与公安部等部门协商时是否有人提出要香港警方帮助将林荣基送回内地，黎栋国表示没有任何方面提出此要求。
香港时事评论员、前资深中国报道记者吕秉权星期三对美国之音表示，中国公安明知两地没有引渡协议，仍然强势提出可能变更对林荣基刑事强制措施，一方面是向港府施压，另一方面也是加大对林荣基的心理压力和威胁，试图让他封口。
他说：“虽然是没有引渡协议的情况下，他们是想借林荣基事件，想加压力给特区政府，也要想一下是不是包庇这个所谓‘逃犯’呀。内地知道它不能够强迫香港交人，也不能够过来把林荣基劫持回去。对林荣基来讲，把林荣基感到那个压力加大，迫到他不敢在公众面前那么高调地去爆料。”
此外，林荣基对外透露，自6月14日返港后先后有6次怀疑被跟踪，尤其是6月29日有四名大汉跟踪他返回临时安全屋，6月30日又遭红衣男子跟踪，令他感到受到“日渐恶化”的俨如“黑社会”的“放肆”的威胁，因此取消参加七一大游行。明报星期三报道，林荣基7月1日决定转换安全屋，致电警方要求派人保护，遭到拒绝。
林荣基星期二接受明报访问时表示，鉴于人身安全考虑，他的想法有变，可能离开香港，或考虑去台湾。民主党立法会议员涂谨申星期三早上在电台节目上表示，内地公安说法具威吓性，担心内地向特区政府施压，不排除林荣基会认为香港不安全，离开香港。
在明显受到社会压力下，署理警务处处长黄志雄星期三在上午的记者会上被问到林荣基人身安全时表示，警方发现，有关跟踪车辆是由传媒租用，目击证人说没发现不寻常，林荣基说法与警方调查发现有出入。不过，基于林荣基表示关注人身安全，只要林荣基愿意，警方愿意提供人身保护。
同时，律政司长袁国强表示，警方需要继续调查林荣基案，在星期二与内地官员会面时，公安部播出林荣基在内地作供片段，如果同林荣基在香港透露详情不符，本港警方便要找出真相。对于媒体追问公安部在讨论通报机制时播放林荣基片段，特首梁振英辩称，会面大部分时间都商讨机制，认为符合双方事前定的讨论范围。
有香港评论认为，内地公安向港府官员播放林荣基在被拘押期间的片断，显示内地公安在事件上态度依旧强硬，不认错。同时，这种让港府官员“被看片”的方式，以及有港官被港媒拍到做笔记，对港府官员起到了“矮化”的作用。
此外，铜锣湾书店店长林荣基7月5日上午，在民主党立法会议员涂谨申陪同下，与警方在一处约定地点再次会面，录取口供大约4个小时，继续就先前提及的事项提供补充资料。涂谨申强调，两地官员星期二会面后，林荣基案件仍存有不少疑问，包括两名陪同林荣基返港的内地人士身份，港府需要跟进。另外，署理警务处长黄志雄星期三提到，警方星期三会再次会见林荣基。
林荣基在内地“失踪”近8个月后，6月14日返港，6月16日没有按照中国公安的要求，携带装有铜锣湾书店订书读者资料的电脑返回内地，并于当晚召开紧急记者会，踢爆在内地“被失踪”真相，引发香港和国际社会哗然，以及全球媒体的关注和追访。
