中国星期六威胁说，如果台湾不承认“九二共识”，北京就将中断双方间的沟通机制。蔡英文总统在星期五的就职演说中仅表示承认有两岸领导人曾在1992年进行过的会谈，但并未直接说出当时的执国民党与北京达成的所谓“九二共识” 。中国负责台湾事务的国台办星期五称蔡英文在两岸关系性质这一根本问题上采取模糊态度说，而国台办发言人马晓光星期六再度强硬表示，只有确认坚持“九二共识”这一体现一个中国原则的共同政治基础，两部门联系沟通机制才能得以延续。与此同时， 中国担当两岸非官方交流机构角色的海协会在同一天也表达了相同的立场。
海协会和海基会的联系在1999年到2008年前民进党总统陈水扁执政期间曾经一度中断，至2008年6月才恢复。
