由于地震之后造成的损害，四川灾区现在正面临水库决堤风险以及堰塞湖崩溃的洪水危机，同时各项疾病的威胁亦开始出现。
根据苹果日报报导，中国水利部部长陈雷在星期四坦承，目前地震灾区的水库、水电站及堰塞湖的防洪出现问题，尤其四川省的水库多，情况叫人担忧。
估计四川省和重庆市共有520座水库出现裂缝或呈现危险状态。已经有2250年历史的都江堰，其“鱼嘴分水堤”出现了裂缝，外江闸管理房以及备用电机房倒塌。
美联社的新闻照片显示，在都江堰上游的紫坪铺水库，因为地震出现了裂缝。另根据路透社报导，都江堰西北方的联合华水库，已经出现了拳头可以放进去的大裂缝。而太平驿电站水库则随时有崩塌危险，当地上百万居民生命受到严重威胁。
*堰塞湖可能造成洪水*
而台湾的福尔摩沙卫星二号所拍摄的灾区空照图，则显示出灾情惨重的北川县由于地震造成山崩，崩落的土石阻断河流而形成至少三个堰塞湖，总面积达到0.287平方公里，也就是约四十个足球场那么大，最大的面积有0.15平方公里。而北川地区山坡崩塌面积达到1442公顷
这些出现裂缝的水库以及地震后形成的堰塞湖，将可能因为下大雨之后，蓄积的水压过大而溃决，到时将在原本就已受创极深的地震灾区，造成洪水灾害。
*泥石流可能持续多年*
此外，由于下雨地滑，以及接下来的余震，也将形成泥石流。根据评估，这种大地震之后的泥石流可能持续二、三十年之久。灾后除了防止各式各样的二度灾害，还必须进行多年持续的整治工作。
*震灾之后防病灾*
随著气温逐渐升高，灾区卫生设施遭到破坏，四川地区瘴疠之气又重，各种传染病的威胁也逐渐升高。根据苹果日报的报导，德阳市下辖的棉竹市等地，已经陆续传出幸存儿童出现红疹症。
根据香港星岛日报报导， 医生无国界组织香港办事处干事李璧君表示，由于灾区严重缺乏有效医药，许多在地震中受伤的骨折病患已经开始出现并发症。
而台湾联合报引用新京报的报导说，北川县城罹难者的尸体严重腐烂，并且散发出尸臭。绵阳市疾病控制中心副主任李六林表示， 北川地处涧河上游，目前尸体腐烂，已经对河水造成污染。加上天气炎热，脑炎、疟疾、霍乱、肝炎和伤寒都有爆发的潜在危险。
根据中国官方说法，本次地震已经至少造成接近2万9千人死亡，估计死亡人数可能超过5万人。至少有五百万人无家可归。
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