台湾副总统吕秀莲说，中国在台湾海峡中线西侧划定新的民航机航线，威胁台湾安全。目前台湾已经透过国际组织向中国表达不满。
吕秀莲说，中国大陆通过香港民航处11月26号知会台湾民航局有关未来新增航线的相关措施。这个新航线距离台湾和中国之间的海峡中线只有4.2海里。中共中央军委12月初通过了这项决议。吕秀莲担心接近海峡中线的新航线威胁台湾军方的两个靶区和台湾空军飞行训练空域，影响台湾飞往金门和马祖的民航航线。此外，新增航线也可能造成军事误判，引发两岸冲突。吕秀莲批评中国政府蓄意制造事端。
台湾总统陈水扁曾经于12月9号向来访的美国国会议员传达类似的信息。
*中国称从未承认中线分界*
台湾和中国大陆的军方为避免发生意外的摩擦和冲突，都自我克制不越过台湾海峡中线。但中国表示台湾海峡为其领海，没有承认海峡中线作为两岸分界，增加新航线的原因是为了因应北京奥运即将吸引大量游客的需要。
亲民党立法委员张显耀担心解放军将在台湾明年3月入联公投通过之后利用新航线对台湾发动攻击。他说：“北京认定入联公投是法理台独。根据去年3月通过的反分裂国家法，一旦进行法理性台独，北京就可以进行非和平手段，这些都是非和平手段之一。”
台湾国防部长李天羽12月17号在立法院回答立法委员质询时说，台湾军方密切关注这一事件的发展。他说，从中国划定的新航线飞过海峡中线只需要20秒，中国的战机从中国大陆飞到台北上空也只需要3到5分钟，但是台湾对入侵领空的飞机有地面防空火力的准备。
李天羽说：“不能确定的情况下我们有地面飞弹防空系统，包括管式的火炮系统。”他说，为了实际需要，民航机确实有接近或者超过海峡中线的可能，过去已经有中国大陆民航机因为天侯因素而跨越海峡中线。台湾认为只要是无害的飞机，都会配合民航机的需要。
*台防长称不会主动挑衅*
但是李天羽也指出，目前中国并没有规划这条航线的具体时间和做法，他也不认为中共会借此发动军事行动，未来台湾空军将继续坚守两岸以海峡中线为界的默契，不会主动挑衅。
李天羽说：“这条所谓中线，我们从设立到现在，始终认为是一个虚拟的中线，让双方都有一个约制。目前为止，中共还没有正式的规划时间，如何来做这条航线。”
台湾国安局局长许惠佑认为中国片面改变航线的做法涉及改变台海现状，未来可能发生的问题是航线重叠，造成飞行安全问题。许惠佑说，台湾已经透过国际民航总局向中国表达意见。台湾自由时报报导，根据国际民航组织规定，新航线公布之后，国际社会可以在40天内表达意见。台湾驻美副代表高硕泰指出，已经有其它国家就此向北京政府表达关切。
