为了缓解日中、日韩在靖国神社问题上的尖锐对立，日本国内很多人认为，可以修建一个新的追悼设施，或者把甲级战犯从靖国神社分离出去。然而靖国神社表示，按照日本国内的法律，这些战犯并不是“罪人”，凡是纳入靖国神社的“神灵”都不能分割出去。
中国和韩国都把靖国神社祭祀甲级战犯作为反对小泉参拜的理由。
*被处死刑的战犯被认定为殉职*
靖国神社广报科科长大山以书面形式接受记者采访时表示，日本国内并没有把甲级战犯视为“罪人”。大山科长指出这是有法律依据的。按照日本的《遗属援护法》和《恩给法》，甲级战犯的遗属不仅与所有阵亡者遗属一样，享受日本政府提供的遗属年金和抚恤金，同时被处以死刑的战犯被认定为“殉职”，他们在监狱服刑期间也按照任职期计算，国家发给他们养老金。
大山指出，《恩给法》是向忠实效劳国家的人发放养老金。该法还规定，曾经被判处3年以上徒刑或监禁者被排除在外。因此，既然甲级战犯遗属享受这些待遇，就意味着他们并不是“罪人”。
*甲级战犯获释，成为内阁成员*
战后，日本甲级战犯很快被释放，有的人还成为内阁成员。1948年11月，在东京举行的远东军事法庭判处25名甲级战犯有罪，其中7人被判绞刑，同年12月执行。不过，1953年日本国会通过赦免战犯服刑者决议，到1958年为止，包括甲级战犯在内的所有战犯均获释。
在这之前，日本先后修改《战争负伤、阵亡者援护法》和《恩给法》，决定向战犯遗属也发放遗属年金和抚恤金。把被处死的战犯定为“殉职”。同时这项法律没有设定不许甲级战犯恢复公职的限制。由此，两名甲级战犯重光葵和贺屋兴宣获释以后，分别就任日本副总理兼外相和法务大臣。另一名甲级战犯嫌疑人岸信介后来还成为日本首相。
1978年，靖国神社把14名甲级战犯纳入该神社祭祀供奉。
*靖国神社反对将甲级战犯分离出去*
针对把甲级战犯从靖国神社分离出去的建议，靖国神社表示坚决反对。靖国神社主张，按照神道信仰观念，一旦纳入神社祭祀成为“神”以后，即使将其分离出去，其神灵也不会迁移。
星期一，在日韩首脑会谈上，日本首相小泉表示，打算讨论修建新的追悼阵亡者设施。这是向反对参拜靖国神社的韩国作出的一个回应。针对修建新的追悼设施，日本国内反对意见仍然强烈，小泉也表示，新的设施并不能取代靖国神社。
日本前外相高村正彦星期一在东京发表讲演时也表示担忧。他提出，如果新的设施建成以后，首相还去靖国神社参拜，那就无助于解决问题。
靖国神社广报科科长大山对于新的追悼设施表示，靖国神社对此不便表示反对或是赞同，不过他说，我们对新的设施有一种“异样”感觉。他例举数字说，每年来靖国神社参拜的人数达500万人次，这比美国的阿林顿国家公墓每年400万人次还多，因此可以说，靖国神社是代表日本的慰灵中心设施。
