国民党总统参选人马英九星期五表示，这次访问日本有很多收获，令日本了解他对台日、两岸以及美台关系的政策，并有助日本了解他不反日也不亲中的立场。民进党总统参选人谢长廷阵营表示，马英九对台湾的国家定位以及未来走向并无中心思想。
国民党总统参选人马英九星期五结束3天的日本访问行程，在离开日本前举行记者会表示，这次访问日本有很多收获，令日本了解他对台日、两岸以及美台关系的政策。
马英九说，他接触的日本朝野政党人士，对他提出的政策都相当肯定。马英九说，去年访问日本时，感受到日本对他的误会相当深，两年来的两次访问应该有助日本改善对他的误解。
马英九说：“我基本上并不反日，我基本上是希望促进台湾跟日本的关系，而台湾跟大陆改善关系，也不是为了要反日或者是要亲中，而是实践一个以台湾为主、对人民有利的政策。”
马英九表示，去年7月访问日本时，曾和当时的外相麻生太郎，以及当时是众议员、现在担任日本首相的福田康夫见面。马英九说，两人基本上都欢迎他对中国的立场，认为有助台海安定，减少日本对南边的忧虑。马英九重申不统、不独、不武的对大陆立场，如果当选总统，任内不会和大陆谈两岸统一问题，不会支持台湾独立，不会片面改变台湾现状。
民进党总统参选人谢长廷阵营发言人赵天麟接受记者访问表示，马英九身为要角逐台湾总统的候选人，但是他对台湾的国家定位以及未来走向并无完整的中心思想，有时候会提到两岸终极统一，有时候又会把台湾定位为不是国家的政治实体，这次访问日本又谈到不统、不独、不武。
赵天麟说：“或者是马英九在台湾的时候，面对渔民会说强力打击、取缔日本的渔民，但是到了日本马英九又说自己并不是反日派，一个这样反覆，没有中心思想的候选人，值得大家深思，是一个非常不适合担任国家领导人的人，这是谢长廷阵营的看法。”
赵天麟说，谢长廷也有计划在明年台湾总统大选前访问日本，目前预计可能在12月成行，但仍未完全定案。赵天麟说，谢长廷曾经留学日本，在选前访问日本可以展现他的国际观，也可以在这样的国际舞台上，呈现谢长廷对台湾未来国际定位的重要机会。
台湾大学政治系教授张亚中接受记者访问表示，大部份日本传媒一向都认为马英九是亲中派，因为马英九在钓渔台问题上与日本的立场不一致，而且马英九以及国民党对中日8年抗战的解读与民进党也不一样。张亚中说，这次马英九访问日本，有助日本了解如果马英九当选台湾总统，不会采取亲中立场。
张亚中说：“马英九向日本表达既不亲日也不仇日，而是‘知日’，就是了解日本。第二也向日本表态不搞统一，希望日本媒体有比较和缓的态度，因为相对谢长廷与前总统李登辉都是日本基本上非常支持的，而且日本也认为支持谢长廷和李登辉在某种概念上可以与台湾保持友好关系，而台湾所谓潜在台独的走向，其实也是符合日本国家利益，所以这次马英九访日有助日本化解对他的疑虑。”
立场倾向泛绿阵营的自由时报星期五的社论标题是“马英九的政治思维是为终极统一铺路”。社论指出，在日本访问的马英九重申不统、不独、不武政策。社论认为，台湾是一个主权独立的国家，中国以武力威胁台湾，企图统一(并吞)台湾，乃是国际法上的侵略行为。马英九要求中国“不统”、“不武”，是理所当然的，但不可以为此“不独”，阻断台湾国家正常化之路。
立场倾向泛蓝阵营的联合报星期五以“马英九秀日语、我是知日家”为标题，简单报导马英九的访日行程，在面对日本议员质问，引用国际法坚持自己对钓鱼台和冲之鸟岛的立场，还用日语和横滨市长举行一场互用对方语言演讲的比赛。
