美国国防部代理部长帕特里克·沙纳汉星期二（1月1日）说，国防部“依然致力于保护我们的国家”。沙纳汉这一天正式接掌前防长马蒂斯辞职留下的职位。
沙纳汉在一份声明中说，“现在我期待着跟特朗普总统合作，跟包括各位现职部长、参联会主席、作战指挥官和国防部长办公室资深人员在内的这些强有力的领导人一道实现他的愿景。”
沙纳汉没有任何军旅经验，而马蒂斯在担任防长之前是一位受爱戴的海军陆战队将军，参加过阿富汗战争。沙纳汉2017年任职国防部之前在航空业巨头波音公司供职30多年，监管民用和军用相关的项目。
马蒂斯12月20日辞职，辞职前，他到白宫参加会议。期间，马蒂斯在从叙利亚撤出美军的问题上跟特朗普总统产生分歧。美军在叙利亚一直帮助打击伊斯兰国恐怖组织。
星期一（12月31日）是马蒂斯在岗的最后一天，他在正式的告别信中说，“我们国防部的领导层，无论文职还是军人，仍然掌握在最棒的人手中。”
马蒂斯在信中接着说，“我坚信，你们每一个人都不会偏离我们宣誓时的使命，那就是支持和捍卫宪法，同时维护我们的生活方式”。“因此，要对我们的国家保持信心，跟我们的盟友一道，坚定地团结起来，对付我们共同的敌人”。
尽管这并非是马蒂斯在政策方面跟特朗普的第一次分歧，但对马蒂斯来说，有关叙利亚撤军的决定是一个转折点。
马蒂斯在辞职信中写道，“你有权有一位国防部长，他在这些问题和其他问题上跟你的观点更加一致”。马蒂斯还说，他会留任到2019年2月底，以便有时间找到继任者。同时他也可以代表美国出席北约防长会议。
马蒂斯还警告总统说，美国“对有些国家必须表现出坚定、明确的立场。这些国家的战略利益跟美国的战略意义越来越冲突。”马蒂斯提到了中国和俄罗斯。
此外，他还进一步警告说美国无法承受疏远盟友带来的后果。
“我们作为一个国家的力量与我们独特且全面的盟友和伙伴体制的力量分不开。”
三天后，特朗普通过推特宣布马蒂斯将在年底离任。
五角大楼官员表示，马蒂斯自己申请的离任将不会受到通常给予带离任国防部长的号角齐鸣式的致敬。
马蒂斯和代理国防部长沙纳汉的权力交接仪式是通过一通告知所有政府部门指挥权被更改的电话完成的。
五角大楼公布马蒂斯的离别信息后不久，特朗普就在推特上发文。
他写道：“我是全美国唯一一个说‘我会把我们伟大的军队在胜利后带回家’还会受到媒体负面报道的人。”
马蒂斯作为国防部长的最后一条信息以美国总统林肯在1865年美国内战结束两个月前向格兰特将军发送的电报中的一段话开头。
信息写道：“不要让任何出现的事情改变、阻挡或延迟你的军队行动或计划。”
