Para pejabat keamanan mengatakan Shahid Usman dan empat tersangka lainnya ditangkap pekan ini di kota pelabuhan di Pakistan selatan itu.
Para pejabat menggambarkan Usman sebagai kepala sayap al-Qaida di Karachi.
Al-Qaida mengumumkan pembentukan cabang Asia Selatan pada bulan September, dan pemimpin kelompok itu, Ayman al-Zawahiri, mengancam akan mengibarkan bendera “jihad” dan memperluas pemerintahan Islam di anak benua India itu.
Dalam video berdurasi 55 menit yang ditayangkan lewat internet, Zawahiri mengatakan unit baru al-Qaida di benua itu akan menyelamatkan umat Islam dari ketidakadilan dan penindasan di negara-negara bagian Gujarat, Assam dan Kashmir di India, dan di Bangladesh dan Myanmar.