台湾陆委会主委王郁琦和首次来访的国台办主任张志军6月25日下午在桃园诺富特饭店进行为时两个小时的第二次两岸事务首长会议。
会后国台办由国台办发言人马晓光主持半个小时的记者会，随后台湾方面由陆委会主委王郁琦自己主持记者会，说明会谈内容与进展。
王郁琦说，在两岸两会互设办事机构的人道探视方面，双方达成共识，会纳入互设办事机构的功能。至于互设办事机构的行为规范，双方也有积极正面态度。
在陆客到台湾中转问题上，王郁琦说，两会在今年二月下旬第二次两岸协议成效与检讨会议中，同意就开放“陆客来台转机”议题研究可行方案，双方今天进一步同意安排有关单位展开沟通。
王郁琦说，在两岸经济合作和区域经济整合方面，针对台湾社会对两岸服贸协议的关切，他在会中表示，希望协议生效后，由双方尽速依据服贸协议第二章第8条紧急情况的磋商、第11条例外措施及第四章第19条定期检视等，启动后续磋商，他说，张志军对此也做了正面回应。
王郁琦表示，他再次强调台湾对加入TPP和RCEP有非常强烈的意愿，这对台湾来说是生存问题，不是政治问题。如果台湾能顺利展开和各国的经贸合作，也有助于提升台湾民众对推展两岸经贸合作的信心。针对台湾加入TPP和RCEP等问题，国台办发言人马晓光说，双方同意启动共同研究。
关于众所关注的马习会，马晓光表示，这次会议中双方并没有就这个议题进行讨论。
针对国台办发言人范丽青在此之前表示，台湾前途应由全中国人民决定，陆委会王郁琦说，他在会中针对两岸观念分歧部分，明确告诉张志军，台湾各界高度关切台湾未来由谁决定，台湾政府的立场是台湾前途在中华民国宪法架构下，由台湾2300万人民共同决定，这是台湾人民共识，希望陆方尊重。
国台办发言人马晓光在记者会上说，涉及中国主权和领土完整问题，国台办已经多次表明立场，这是一贯的立场，他说，对于如何处理两岸政治分歧，已经多次表明中国政府的主张。
