台湾星期四（2月6日）“斥责”世界卫生组织（WHO）屡次以不当的方式称呼台湾，指出台湾并非中华人民共和国的一部分。
台湾外交部长吴钊燮2月6日发推文质问世卫组织“你到底有什么毛病？首先叫我们‘中国台湾’，之后又改成‘台北’”，“现在又叫我们‘台北及周边地区’。看清楚，‘台湾就是台湾’，并非中华人民共和国的一部分。”
在每天发布的新冠病毒疫情报告中，世卫组织对台湾的称呼几经变化。在1月22日的报告中以“中国台湾”称呼台湾；23日的报告则称台湾为“台北直辖市”；25日又改成“台北”；2月5日以“台北及周边地区”来称呼台湾。
台湾外交部发言人瓯江安星期四在记者会上表示，世卫组织“到底要改几次名字？而且都是错的！”
她说：“我们是台湾、正式国名是中华民国，不叫台北、台北直辖市或是台北及周边地区”。她指出，世卫组织用错误的名称矮化台湾是“昧于事实的荒谬行径”。她说：“台湾就是台湾，台湾绝对不是中华人民共和国的一部分”。她要求世卫组织不要一错再错。
瓯江安还表示，台湾外交部和驻日内瓦办事处将持续表达严正抗议，要求世卫组织更正对台湾使用的不当称呼。
另一方面，台湾主管大陆事务的陆委会星期四对中国“以片面政治主张排除台湾参与WHO并发表不实言论”，表达严正抗议。
中国国务院台湾事务办公室负责人2月6日就世卫组织涉台问题发表谈话指出，在中国抗击新冠病毒疫情时，台湾民进党当局和“台独”分裂势力“伺机鼓噪所谓台湾参与世卫组织议题，企图利用疫情趁火打劫，拓展所谓台湾的‘国际空间’”。
这位负责人在谈话中称，根据联大、世卫组织有关决议和世卫组织《组织法》，台湾作为中国一部分无权加入世卫组织。而且，民进党政府上台后，拒不承认“九二共识”，不断挑战一个中国原则，“令中国台湾地区参加WHA（世卫大会）的政治基础不复存在。”声明还“奉劝”民进党当局“立即停止在世卫组织涉台问题上的政治盘算和政治操弄”，“‘以疫谋独’是绝不会得逞的”。
台湾陆委会星期四抗议“中共阻挠台湾参与WHO”，指出“北京当局错误引述联大及世卫决议，并与其片面设定的‘一中原则’连结，这些政治操作已明显违反世卫宪章与国际关系原则。”
陆委会的声明强调“中共当局切勿将政治因素凌驾在人类健康安全之上”，“所谓‘以疫谋独’乃推卸责任、转移焦点上纲之举，无助改善两岸关系”。
此外，台湾外交部星期四（2月6日）表示，中国向世卫组织提供的台湾新冠病毒确诊病例的信息有误。
由于中国的反对，台湾不是世卫组织的成员。北京说，台湾是中国的一个省，不是一个国家，中国能在世卫组织充分代表台湾。但是，台湾自称是一个独立的国家，其正式名称叫中华民国，台湾从来不是中华人民共和国的一部分。
星期二，世卫组织修正了台湾报告的确诊病例。此前世卫组织称台湾的确诊病例为13例，但实际上台湾当时的确诊病例为10例。
星期四，台湾称目前的确诊病例为13例。与此同时，中国星期四公布的累积确诊病例为28018例，死亡累积563例。
