“马习会”星期六在新加坡登场之际，台湾有团体和民众在台北举行抗议，谴责马英九出卖台湾利益。
星期六马习会在新加坡前。台北出现抗议两岸最高领导人会见的活动。大约200多人连夜抗议，活动一直持续到星期六天明。
在位于市中心的台湾立法院门前和周围地区，台湾团结联盟等政党成员，打出抗议马-习会标语，呼喊反对马英九，以及要求台湾独立等口号。有标语上写有“台湾，中国，一边一国”，“停止贸易谈判”，“弹劾马英九”等。
抗议者孙云春（音）说:“虽然马英九嘴巴上讲不会签署什么，但是马习会本身就代表说，他们在那边会有相关的讨论和谈判，但是未经人民的许可。”
有抗议者将标语直接放在铁丝网上。马习会的消息宣布后，台湾政府主要机构加强了戒备，总统府周围增设了铁丝网围拦，以防抗议者冲入。
抗议者张任伟（音）说： “我们认为，马英九在卸任前两个月这个敏感时机，选择做出这么大的政治决定，无非想在很短时间内，政权交出去之前，就急于把台湾社会的利益，特的个人利益和党国利益，拿去交换。”
参加集会和抗议的人士认为，“马习会”是台湾成为中国一部分的前奏。
现场抗议者和警察爆发肢体冲突。有抗议者被警察拘捕后带离。还有警察在街头追赶参加抗议的妇女，现场拍照的摄影记者也被警方人员驱离。
不过，抗议群众的规模后来有所减弱。与此同时，台湾各界密切关注马习会上，双方最高领导人的讲话内容以及会后记者会上传出的信息。
