台湾大陆委员会发言人邱垂正表示，截至目前，在大陆失联的台湾人仍有48个还未能确认行踪。
邱垂正在10月15日的记者会上再次提醒台湾人注意在中国被任意拘留的风险，并指出许多所谓的台湾间谍是在正常的学术交流中被拘留的。
他说，台湾政府有关部门对仍然失踪的案件正在调查中，并已经联系了提交失踪人员报告的个人。
邱垂正说，自2016年5月20日以来，台湾海基会已经收到149起台湾人在中国失踪的报告。在失踪人员中，101人已经回国或向台湾官员通报了他们被拘留的消息，而48人仍下落不明。
中国当局近日加强对台湾的“反谍”行动。中共官媒中央电视台在10月11日的《焦点访谈》节目上又上演电视认罪，播出台湾人李孟居接受采访的片段，他对着镜头表示过去做了很多错事，“觉得很抱歉”。该电视台在同一天播出的《新闻联播》节目中说，中国有关部门过去一年来展开专项行动，成功破获数百宗间谍窃密案件，拘捕包括李孟居等一批台湾间谍和相关人。
国际人权组织“保护卫士”2018年6月发布的调研报告指出，从2013年7月到2018年2月，媒体人、人权律师、非政府组织人员等中国公民、香港居民、外国公民在内的37人，共45例电视认罪者，其中包括高瑜、林荣基、瑞典公民铜锣湾书店老板桂民海、瑞典人权工作者彼得·达林。
对于中国大陆近期炒作所谓“台谍案”，邱垂正在星期四（10月15日）陆委会的例行记者会上表示，中共接二连三对从事两岸交流人士，以所谓“破获间谍”名义，滥捕并编造子虚乌有、罗织入罪的剧情，一再恶意政治炒作，刻意破坏两岸关系与正常学术交流。
邱垂正表示，陆委会“谴责北京当局，企图干扰台湾社会，恫吓台湾人民的粗劣行径”，并严正警告对岸，“应立即停止这种恶劣操作”。
中国国台办发言人朱凤莲星期五（10月16日）发布新闻稿称，台湾陆委会所谓“149例台胞在大陆失踪”的说法与事实严重不符，完全是恶意炒作。她说，事实上，在大陆有关方面的“协助”下，很多所谓“失联台胞”已经与家人取得联系或返回台湾。
一天前，中共党媒《人民日报》10月15日发表“站在历史正确的一边——告台湾情治部门书”的署名文章，指责蔡英文政府与“外部势力勾结”让“台湾情治部门积极充当台独分裂势力的马前卒，大搞不义之举，大行忤逆之道”。文章警告“台独分子”不要“自寻绝路”。不过，这篇署名安平的文章最后“欢迎台湾情治部门中拥护祖国统一的有识之士，有机会多到祖国大陆走一走、看一看”。
人民日报的这篇文章被认为内文辞藻华丽却空洞，除了恐吓加统战的软硬兼施之外，没有新意。
习近平掌权以来，中国的失踪现象盛行。非政府组织“保护卫士”（Safeguard Defenders）指出，现今中国有两个使人失踪的制度——其一是指定居所监视居住，另一个是中国新成立的国家监督委员会下的全新“留置”制度。这两个制度让人员失踪合法化。
在中国被失踪的人员大多是被控“间谍”,或是涉嫌“煽动颠覆国家政权”等政治罪。
