台湾政府对于中国推迟实施M503新航路表示勉强可以接受，但是仍然不满意。在野党要求政府采取行动捍卫国家利益。
针对中国推迟实施引发争议的M503新航路，并将该航路西移6海里，台湾总统府表示，不甚满意，勉予接受。台湾行政院长毛治国星期二在立法院接受媒体采访时，表达了这个立场。
台湾执政党国民党立委赖士葆表示，中国大陆确实释出了善意，表面上台湾不是那么满意，但事实上可以接受。
他说：“因为经过朝野党团所提的共同决议，基本上行政部门也做到了，所以我们的尊严、坚持，事实上也获得善意的回应，所以这一部分，在大陆官方来说，目前这样的处置，就这个阶段，勉强可以接受。”
至于这项争议是否已经伤害两岸之间的互信？赖士葆委员认为，两岸关系已经进入深水区，难免跌跌撞撞，但是往前走的大方向不会改变。
台湾陆委会和交通部星期一晚间召开记者会表示，两岸确认M503航路延后启用，未来确定实施的日期，双方将再沟通，至于W121、W122、W123等3条航路现阶段不启用、不实施。
输了里子
在野党民进党立委黄伟哲表示，两岸关系要走得长、走得久，双方还是要多一点相互尊重，台湾在这项争议当中，面子是拉回了一点，可是却输了里子。
他说：“因为航线还在那儿，而且人家还是要照飞，人家只是延后，延后一天也是延后，延后一年也是延后，到底延后多久，人家也不会告诉你，这方面，里子上并没有占到任何的便宜。”
黄伟哲委员还说，中国大陆如果要展现善意，越晚实施这些新航路越好，此外，两岸之间的许多新措施，一定要先照会对方，并且按照协议来走，双方的关系才可能走得长久。
台湾在野党民进党发言人郑运鹏强调，中国划设M503航路等新航路，并没有依照国际民航公约的精神和台湾完成沟通协商，此举冲击台湾飞航安全、国家安全和主权，台湾民众难以接受，该当表达严正抗议，马政府也应该采取行动捍卫国家利益。
台湾国防部表示，还是会依照现行空域范围执行空防安全任务，对于台湾海峡附近空域航机，将有效掌握、适当处理，以维护国家安全。
柏林围墙
另一方面，中国国台办发言人马晓光星期二表示，开通M503航路本是大陆自家的事，台湾应该推倒两岸心里的柏林围墙，而不应该做毫无科学根据的猜测。
中国民航局空管局长车进军还告诉台湾媒体参访团，M503航路推迟实施，这是大陆最大的善意表现，他说，这条航路是两岸之间的和平线、和平航线。
中国今年1月单方宣布划设包括M503在内的4条新航路，并将于3月5号实施，台湾对此高度不满，认为将影响飞航安全，经过协商之后，达成目前的共识，这项争议也促使双方取消主管两岸事务最高官员于2月初在金门会面的计划。
