台湾行政院长赖清德10月3日在接受国民党立法委员质询时表示，蔡英文政府不会宣布台湾独立，也不会推动台独公投。
赖清德说： “不要说我们跟对岸彼此存在很多不了解，我们台湾政党彼此之间的了解也不够，大家都认定1991年的民进党党纲主张台湾共和国，但没有注意到1996年民进党的台湾前途决议文已经谈到，台湾已经是个主权独立的国家，名字叫中华民国。未来的前途由2300万人决定。特别在1996到1997年间，施明德当党主席时就已经公开宣布，民进党如果执政不会对外宣布台湾独立。”
赖清德说，陈水扁的时候就没有宣布，蔡英文政府也不会宣布。至于台独公投，赖清德表示，现在没有一个政党和政府要去推台独公投，政府不会为了台独发起公投，民进党内部也没有这个计划。
前台南市长赖清德过去多年来被台湾各界广泛认为有一天他会参选总统选举，因此他的两岸论述总会引起各界关注。赖清德于九月初接任行政院长职务，在他9月26日第一次到立法院备询时就说自己是“一个主张台湾独立的政治工作者”，成为第一位在国会表示支持台独的行政院长，引发各界热烈争议。 随后赖清德表示，两岸是总统职权，他的政治主張和兩岸政策不同，他率领的行政院是在蔡英文的领导下，维持两岸现状，巩固台湾主权。
在此之前于今年六月，赖清德在担任台南市长任内抛出亲中爱台论。他当时表示，“我不反中，我亲中爱台。支持台独并不代表反中；‘亲中爱台’和‘倾中卖台’不同，我无论担任任何职务，主张台独的立场不变。”
赖清德最近在立法院表示，台独的主张与‘亲中爱台’并不违背，因为亲中爱台是以台湾为核心，表达对中国亲善的态度、伸出友谊的手。他说，他希望两岸求同存异，透过交流增进彼此的了解、理解、和解、谅解，然后和平交流。
针对赖清德之前提出的台独论，台湾总统蔡英文最近在接受台湾媒体中央社专访时表示，她后来和赖清德就这个问题进行简短讨论，她说，总统不可能规定行政院长一定讲什么，或怎么讲事情。她说，赖清德是个有经验的人，也应该知道分际和整体政策走向。她说，相信后来大家都看到赖清德清楚说明了相关态度。
