近年来，美国民间针锋相对的宗教自由辩论也反映在多元化的军队当中。最近，一位海军随军牧师因为被指控在为士兵提供心理辅导时发表了针对同性婚姻和婚前性行为的不恰当言论被上级调离，并等候进一步的调查。专家提出，这类事件在美国军方已经不再是孤立事件。
随军牧师被调离调查
美国核动力训练司令部(NNPTC)的指挥官乔恩·法斯(Joh Fahs)上校2015年2月在致海军人事司令部的一份备忘录中表示，他们经过调查发现，海军少校、随军基督教牧师韦斯利·默德(Wesley Modder)在给海军学员进行心理辅导时，发表了不恰当的言论。
根据几位学员的指控，默德告诉他们同性恋行为是错误的，因为阴茎是为阴道，而非肛门预备的。此外，他还斥责一位女学员未婚先孕，并且告诉另外一名女学员，婚前性行为在上帝眼中是可耻的。
基于上述行为，法斯建议对默德采取三个行动步骤，首先，将其调离，其次，将他从军队的晋级名单上除名，再者，把他送交海军调查委员会，以查明是否要对他采取法律行动，进而开除出海军。目前，默德牧师暂时被安排到另外一个地方，等候进一步的调查。
由于默德牧师已经在军队服役19年，而且很快就到了20年的退休年龄。因此，一旦被海军调查委员会强迫提早退休，他的退休福利就有可能大幅度减少。为了保护自身的权益，应对有可能出现的法律诉讼，默德牧师聘请了致力于保护宗教自由的非盈利法律机构“自由研究院”(Liberty Institute)为他提供法律辩护。
律师为牧师权益辩护
默德牧师的法律顾问、“自由研究院”的资深律师迈克·贝里(Mike Berry)指出，作为随军牧师，默德的行为无可厚非，因为他在给士兵进行心理辅导时只是依据他的宗教信仰直言不讳地表达了自己对一些问题的看法而已，而且他的这个做法是受到美国宪法第一修正案宗教信仰自由条款以及其它联邦法律的保护的。
贝里律师表示，根据美国国会通过的《2013年国防授权法案》(National Defense Authorization Act of Fiscal Year 2013)的内容，随军牧师和军人在涉及道德和宗教信仰的问题上有遵循自己宗教信仰的宪法权利。很明显，对默德的处罚违反了这个法律。
此外，对默德牧师的处罚也触犯了美国国会通过的《宗教自由恢复法案》(Religious Freedom Restoration Act of 1993)。
贝里说：“这是国会1993年通过的一项法律。它禁止联邦政府对某人虔诚信奉的宗教信仰施加实质性的负担，除非政府可以证明它有令人信服的理由这么做，而且必须将限制减少到最低程度。”
军规限制宗教自由权
但是，前美国空军军官、“军事宗教自由基金会”的创始人和主席米基·维恩斯坦(Mikey Weinstein)律师指出，根据美国联邦最高法院1974年在帕克起诉列维一案(Parker vs. Levy)中的判决，一旦某人穿上军装，他的很多宪法权利就会受到极大限制。
维恩斯坦说：“一旦在军中服役，你的很多权利就立刻失去了。你不再象平民那样，可以充分享受宪法第一修正案的权利。对政府来说，利益攸关的事情不再是确保你的这些权利，而是最大限度地维护良好的秩序、军队士气和纪律，以建立一个强大的军队，充分保护所有其他人的宪法权利。”
根据联邦最高法院的判决，虽然军人也在宪法第一修正案的保护范围之内，但是，考虑到军队的特殊性以及政府维护秩序的必要性，一些在军队以外宪法所允许的行为在军队里却是不允许的。因此，在维恩斯坦来看，这给随军牧师和军人的宪法权利打了折扣。
维恩斯坦补充说，人们有权不喜欢同性恋者、有权相信可以治愈他们，也有权认为未婚怀孕是犯罪行为，这是他们的私人观点。但是，他们无权用纳税人的钱将自己的观点在军队中实行出来。
军队宗教自由案增多
一些重量级保守派人士，包括2016年潜在总统候选人哈克比、著名基督教牧师富兰克林·葛培理纷纷出面对默德牧师表示支持。
乔治亚州共和党籍联邦众议员、空军后备役基督教牧师道格·柯林斯（Doug Collins）在接受福克斯新闻采访时表示，他将向五角大楼提出默德牧师的问题。他指出，美国军队中遏制宗教自由的问题必须停止，不能强迫随军牧师违背其信仰信条提供心理服务。
但是，默德牧师的事例并非孤立事件。近年来，随着美国军队越来越多元化，类似的宗教自由冲突不断增多，有关辩论也日趋激烈。
据维恩斯坦律师介绍，最近，他代表24名空军官兵向设在北卡罗来纳的西摩约翰逊空军基地(Seymour Johnson AFB)的指挥官提交了一封抗议信，抗议这名指挥官言行不当，要求立刻采取补救措施。这名指挥官被指控告知下属，他们所做的是在从事主的工作。
维恩斯坦指出，该指挥官的言行违反了他宣誓效忠的美国宪法，特别是第一修正案的不得确立国教条款以及相关空军条例，他说，军人的职责是维护国家利益和美国宪法，而不是从事什么主的工作。
但是，包括贝里律师在内的很多保守派人士指出，在美国社会，乃至军队当中，为避免冒犯某一族群而找出各种理由力求政治正确的情况日益严重，以至于真理不敢说，事实不敢讲。他们说，很多基督教牧师因为宣讲基督教原则而面临被起诉，甚至坐牢的风险。
