日本救援人员星期六在恶劣天气中奋力搜救由于两次强烈地震而被坍塌的建筑物掩埋或困住的大约100人。日本动用了数万警察、急救医务人员、消防队员以及自卫队员进行搜求。抢救行动受到恶劣天气的阻碍。日本媒体报道，确认的死亡人数为41人，将近两千人受伤。
日本气象厅说，星期六地震的强度为里氏7级，之后发生的一系列余震中，有一次强度为5.4级。日本首相安倍晋三担心星期六的降雨和强风天气影响在受到严重地震破坏的九州岛的搜救行动。安倍原计划前往九州岛的熊本市视察灾情，但是由于余震不断，取消了视察计划。星期四第一次强烈地震后已经发生了140次余震。
若干建筑在周六的地震中坍塌，其中包括一栋大学宿舍楼，造成两名学生死亡。日本内阁官房长官菅义伟表示，倒塌的楼房内至少有23人被埋，大约1500人受伤，其中80人伤势严重。
在九州岛的地震引发山体滑坡，冲毁了许多民宅，截断了一条高速公路。一座通往南阿苏村的主要桥梁被破坏，加大了对这个地震重灾区实施救援的难度。
