台湾国安会警告说，中国和韩国自由贸易谈判已经接近尾声，一旦两国正式签署自由贸易协定，将对台湾产业安全构成严重威胁。
台湾国安会星期四向立法院提交的一份书面报告表示，中国大陆与韩国自由贸易协议已经完成13回合谈判，对台湾产业构成严重威胁。报告指出，政府希望两岸协议监督条例能够早日完成审议，使两岸贸易协议能及时通过。
报告补充说，两岸互动频繁当然也有潜在的国安风险，国安会将秉承宪法及相关法律赋予的职责，追求两岸关系机会极大化，风险极小化，确保台海和平稳定。
中国国家主席习近平今年7月访问首尔期间与韩国总统朴槿惠共同宣布，力争于年底签署中韩自由贸易协定。马英九总统曾经表示，一旦中韩签署FTA，一定会影响台湾在大陆的市场占有率，拉大台湾与韩国的差距，令他“心急如焚”。
台湾中华经济研究院WTO中心副执行长李淳认为，台湾与韩国出口产品类别相同，中韩自由贸易协定将重创台湾在大陆的市场份额。他说：
“因为就制造业的出口来看，我们跟韩国在产品类别上大概有百分之50，有人说高达百分之80是重叠的。也就是说，凡是在海外市场多买一个韩国产品，那就可能少买一个台湾产品。这种替代关系会让我们认为，韩国如果在某个市场取得一定优势，台湾就会特别担心。”
2008年国民党取代民进党成为执政党后，两岸经贸关系进展迅速，于两年后的2010年便签署了两岸经济合作结构协议（ECFA），接下来的两岸服贸协议也于2013年六月签署。如果按照正常程序，两岸这些经贸协议原本可望在中韩签署FTA之前实施，但今年3月爆发的太阳花学运中断了服贸协议在立法院的审议，更连带两岸货贸协议谈判陷于停滞。
经济学家李淳说，台湾产品原本在大陆市场上的优势，可能将面临韩国低关税的鲸吞，从而削弱国家的经济实力。他说：
“我们可以看到台湾在过去几年每年对大陆的贸易顺差都在900亿美元左右，是台湾目前最主要的贸易顺差来源。如果这个贸易顺差来源因为FTA的原因受到韩国的侵蚀，贸易顺差开始降低，那就会反映在台湾整体贸易的表现。”
但是东吴大学政治系副教授吴志中认为，马英九政府和台湾业界一些人士夸大了台湾和韩国出口产品的重叠性以及中国市场的重要性，目的是加快与北京融合的步伐。吴志中说：
“国安会之所以要做这样一个报告，基本上是马英九政府要让台湾产业更加快速与中国结合，这是他执政以来的一个主要目标。我们都知道太阳花学运阻挡了服贸协议，现在又在谈货贸协议。现在我们的政府就是越来越多地以中韩FTA为借口，让台湾加速与中国的产业结合。”
同时兼任独派团体台湾社秘书长的吴志中教授进一步指出，中国企图在经济上拉拢台湾，然后以经逼政的战略是尽人皆知的，台湾必须要警惕。
他说，“台湾过度依赖中国，对于台湾的安全是有害的。所以在这种情况下，我们跟中国维持适当的经贸关系是必要的，但是不能过于深入。”
面对服贸及货贸协议将导致台湾经济严重依赖中国大陆的指责，马英九总统说，台湾做不到不依赖中国大陆，因为美国推动打造的泛太平洋自由贸易区中，有7个国家都以中国大陆作为第一大贸易伙伴。大陆有市场，有生产力，自然有人要同他做生意。马英九说，无谓的耽搁，只会把机会平白浪费，而继续内斗，斗垮的不是国民党，而是台湾经济。
