台湾总统马英九和民进党主席蔡英文就关系重大的宇昌案直接交锋。马英九立下重誓宣告不会利用司法来进行政治追杀，他还就政府官员利益冲突问题追问蔡英文。蔡英文重申她没有违法也没有利益冲突问题。
几天来国民党人猛攻猛打和民进党人严防死守并大力反击的蔡英文“宇昌生技”公司和台懋生物技术创业投资公司的案子，在12月17日的总统候选人辩论中，上升到马英九和蔡英文的当面交锋。
在辩论前夕，蔡英文召开记者会，重申自己没有违法，还指责马英九到了选举最后阶段才将宇昌案移到特侦组侦查，还要马英九不要躲在幕后动用国家机器打击对手。蔡英文发表讲话后立刻离开会场，没有回答记者问题。
*马立誓取信 蔡重复旧言*
马英九在候选人辩论会一开始就说，蔡英文没有证据就指责他为了选举指示特侦组侦办宇昌案和进行政治追杀，这是对他最严重的抹黑与污辱。 马英九立誓说：“我要在此对全国人民郑重宣示，我绝对没有、也永远不会这样做，如果我有，我立刻退出总统选举。”
蔡英文在随后的开场白中重申她的指责说：“马总统，你的竞选团队动员了国家的机器跟政府的资源，来抹黑对手。政务官用不实的文件，来误导人民，司法机关也配合发动侦查。这些事情违反了行政中立，也违反了司法独立。”
*“利益冲突不回避 面对群疑却回避”*
在辩论的互相提问阶段，马英九说：“蔡主席，很多民众都质疑你，你卸任之后还在家中听取国发基金官员投资的简报。我郑重宣誓，我卸任后，绝对不会要官员到我家来报告。我也绝对不会利用政府的关系来赚钱。蔡主席，你难道不知道公务员卸任后有些事情是不能做的吗？你难道不知道国家领袖的道德水准跟自我要求应该更高吗？你难道不知道发展生技产业的目标不论怎么伟大，自己都不能参与投资跟获利吗？”
马英九谈到，过去的高官李国鼎、孙运璇和赵耀东推动产业，而没有像蔡英文这样参与投资和获利。马英九敦促蔡英文说：“你应该利益回避时不回避，面对问题时却一再回避，民众还在等你的说明！”
*固守防线 以攻为守*
蔡英文答辩时没有做进一步说明，而是重申她的解释：“我没有违法，而且我也事先向行政院去询问，而且取得行政院的意见，是没有违反利益冲突也没有违反旋转门的规定。这是非常清楚的事情。”
蔡英文还表示，对手选择性释放消息，用误植或者变造的公文抹黑她，政府变成选举机器，政务官变成打手，马英九应该负责。蔡英文还质疑，这件事为何在大选前一个月才被关注？蔡英文并且对国民党反唇相讥，谈到马英九的政治献金问题和国民党党产问题。
在辩论后的记者会上，马英九说，过去他们对宇昌案缺乏了解，而现在信息多了起来，这个议题不管有没有选举都要弄清，人民也有疑惑。马英九还表示，他没有预设立场，应由司法机关决定。
*受挫后再战 蓝绿谁领先?*
在这个案子中，一个文件日期错误的事被人比喻成国民党的弹药库发生爆炸。民进党人抓住这一点反守为功，一口咬定台湾经济建设委员会负责人刘忆如故意造假，把这件事作为台湾的水门事件来打。在民进党的凌厉攻势下，蓝营内部就是否要把宇昌案继续打下去出现分歧。而马英九在辩论中的强硬反击显示，国民党决策层不会收兵。
此外，被民进党起诉的刘忆如将在几天内向蔡英文提问。
联合报在辩论会后的民调显示，马英九领先蔡英文8个百分点，而中国时报在辩论会后的民调显示，马英九只赢蔡英文0.8个百分点。但是未来事件交易所预测，蔡英文领先马英九10.3个百分点。
