日本政府首次官方正式回应有香港留学生因在日本时发表网上言论而在回港后被捕事件。这次事件早已引发日本学者担心影响香港人以至日本人的言论自由。日本政府官员指出，已经向中方表达自由、人权与法治在中国受到保障是十分重要的。
日本内阁官房长官松野博一表示，香港警方被指就一名香港女学生在日本留学时作出的网上言论，在她三月回港时以涉嫌“煽动分裂国家”罪拘捕的事件，损害了大众对“一国两制”的信任，以及加剧外界的严重关注。
日本东京大学社会学教授阿古智子月初在日本雅虎网站撰文披露事件，其后日本及国际媒体都有跟进报道。松野博一在星期三的例行记者会上，被《产经新闻》记者问到事件时确认已经知悉事件。
他说：“日本认为，在国际社会中，自由、基本人权和法治是普世价值，在中国得到保障是非常重要的。我们已经直接向中国政府传达了这种立场。”
他又说：“关于香港周边局势，自2020年6月制定《维护国家安全法》以来，发生了诸如逮捕民主派等各种的事态发展。此外，2021年3月，香港基本法有关香港选举制度的规定发生变化，这种情况继续破坏人们对‘一国两制’的信任，并加剧了人们的严重关注。日本将要求香港当局，按照香港基本法的规定保障言论和新闻自由，并与国际社会密切合作，向中方强烈呼吁。”
阿古智子之前对美国之音指，该名23岁女学生被指在Facebook发布煽动港独信息时，身在日本，她是为了更换身份证时才返回香港。她说，该名女学生的言论十分普通，认为类似的案件越来越多，会逐渐影响日本的言论自由。
该名女学生已经取得保释，但护照被没收。阿古智子呼吁该名女学生就读的大学考虑让她参与线上课程。
日本外相林芳正在月初访华，与新任中国外长秦刚首次会面。日本放送协会（NHK）报道，林芳正表达对香港和新疆人权问题的关注，强调台海和平安定的重要，又要求中方尽早释放在三月以间谋罪逮捕的日籍药厂男高层。
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