民进党和台联在星期天落幕的民间国是会议上猛烈抨击政府与中国大陆准备要协商的综合性经济合作协定。台湾政府迅速做出反应，陆委会在星期天晚上临时召开记者会，向媒体说明要在坚持台湾主权的原则下商讨合性经济合作协定，防止台湾被边缘化。星期一，台湾政府和国民党其他官员也发表看法，支持综合性经 济合作协定。
*坚守主权*
台湾陆委会针对民间国是会议中反对党对综合性经济合作协定提出的批评举行了临时新闻发布会。陆委会主委赖幸媛强调坚守主权是重要原则：“政府是采取稳健、审慎以及循序渐进的方式，坚守台湾的主权，这是政府在处理综合性经济合作协定的一个非常重要的原则。我要再次强调，综合性经济合作协定不是卖身契，也不是万灵丹。”
她说，如果不签署综合性经济合作协定，台湾会被边缘化：“我们希望透过像综合性经济合作协定这种推动来突破台湾参加国际多边以及双边的经济合作的困境 。十余年来，我们一直面临到一个瓶颈和困境。 我们希望化解台湾会进一步被边缘化的危机。”
*意识形态与经济合作*
星期一台湾政府和国民党其他重要官员也纷纷表态支持综合性经济合作协定。国民党主席吴伯雄表示， 如何协商，如何不被矮化，主权不受影响，都可以讨论：“我希望不要用意识形态(来沟通)。我欢迎大家来沟通。”
经济部长尹启铭说：“两岸都是WTO会员，在这样的架构下，我们会秉持着公平、对等、尊严的基本原则，与台湾优先，对人民有利。我们不希望把意识形态带到经济合作协定的洽谈过程。”
行政院副院长邱正雄表示， 这是经济问题，跟政治无直接关系。
*标签政治*
陆委会主委赖幸媛还批评在野党的做法是玩弄“标签政治”：“这是都是流于标签式的，也就是标签政治。这是label politics的操弄，而不是政策讨论。”
*不是协议是协定*
说到标签，上星期的例行记者会上陆委会就强调应该叫协定，不是协议。陆委会主委赖幸媛在昨天晚上的记者会上又澄清， 综合性经济合作协定不等于CECA：“两岸之间签署有关的经济协定，他们把它称为CECA，不是政府正在拟定的。政府正在拟定的叫综合性经济合作协定。”
CECA是综合性经济合作协定(Comprehensive Economic Cooperation Agreement)的英文缩写，在此之前从政府官员到反对党到媒体都这样使用。不过，尽管陆委会进行了更正，星期一的新闻媒体还是照旧普遍把它称为CECA。
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