台湾总统马英九发表新年元旦文告，内容包括了两岸关系，台湾经济所面临的挑战等，对此，台湾不同党派立委也发表了看法。
马英九参加就任之后的第一次新年升旗典礼。事实上，在过去民进党执政下，马英九不论是担任台北市长或国民党主席的时候，也都出席总统府的升旗典礼。
*文告未直接回应胡讲话*
马英九随后还在总统府内发表了元旦祝词，在两岸关系方面，他并没有针对中国国家主席胡锦涛日前的谈话作出回应，不过，他指出，大三通将使得台湾和大陆之间的经贸关系日益密切，不过，对台湾来说，这是机会，也是挑战。
马英九说，在两岸关系加强的同时，台湾将积极的维护中华民国的主权和台湾的尊严，并且在政治、社会和文化方面发挥影响力，使得两岸关系朝向正面的方向来发展。
*促企业不要裁员共度难关*
在经济方面，马英九坦承，政府虽然提出了许多的因应措施，但是，经济的局势却依然严峻，他特别呼吁企业尽量不要裁员，应该和员工一起携手打拚，撑过经济的不景气。
在台湾的政治方面，马英九还向在野的民进党喊话，希望彼此放下成见，一起为台湾的经济打拼：“ 全国必需团结一致，不分朝野与蓝绿，一同携手救经济，政府需要人民的监督与鞭策，绝对不会忽略在野党和民间的声音。”
不过，民进党立委蔡煌琅则表示，对于马英九的元旦文告非常失望，也没有太多的期待：“对于执政半年来，经济萧条，民不聊生，整篇文告里没有反省，没有向人民道歉，对于未来执政的展望，我听到的是口号治国。”
国民党立委邱毅认为，台湾经济最坏的情况还没有出现，马政府应该上紧发条，积极的因应这场硬战：“倒闭潮，马上要出来了，而失业的高峰马上要出现了。所以，总统必需要用更大的精力去帮台湾的经济，让台湾的经济能止血。”
马英九在文告当中还强调，台湾必须做好准备，扩大建设，改善生活品质和产业的经营环境。
马英九认为，台湾的外汇存底相当丰厚，负债也少，企业的因应能力也非常的灵活。他说，和其他国家相互比较，这些都是台湾的优势。
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