台湾行政院长刘兆玄表示，社会上从中国毒奶粉事件开始累积的愤怒，政府都察觉到了，希望在海协会会长陈云林来台时，中国当局能向台湾表达歉意。刘兆玄也保证，一定采取更高规格，确保陈云林在台湾的安全。
虽然海协会副会长张铭清已经在星期三上午离开台湾，但是有关他在台南遭到民众推挤倒地的事件继续在台湾政坛发酵。对于张铭清的安全维护出现漏洞，行政当局要如何负责，台湾行政院长刘兆玄星期三傍晚表示，已经将台南市警局局长降职处分，政府已经做了一定的惩处。
刘兆玄还表示，未来在海协会会长陈云林来访时，安全维护的规格一定会更高，因为张铭清是以学术交流的私人身份来台，而陈云林是接受两岸的正式邀请，一定会确保他来台行程顺利安全。
至于张铭清事件对两岸关系的影响，刘兆玄表示，短期来看会有一定影响。他说："我想如果说昨天的事件对两岸关系完全没有影响，没有人会相信，会有一定的影响。第二是说，从长远来看，目前为止，双方都会把这个看作是一个擦枪走火的事件，对于两岸关系或大局应该不会有负面影响。"
*从毒奶事件累积愤怒*
此外，刘兆玄表示，台湾社会从中国毒奶粉事件开始累积的愤怒，政府都理解也察觉到了，希望中国当局能就毒奶粉事件向台湾致歉。他说："我们希望陈云林先生来台之前，大陆当局应该对这个事情有所表达，至少对台湾人民要致歉，我想这会使这种情绪能够疏解，台湾人民都很善良的，你只要表达了歉意，我想大部分的台湾人会有一些谅解。"
而针对台湾前总统陈水扁表示，他之前遭到抗议民众的肢体攻击，没有警察局长下台，但张铭清被推倒，却将台南市警局局长撤换，质疑刘兆玄内阁有双重标准。对此，刘兆玄表示，两个案子情况不同，很难比较，不能比谁被踹，而是要看谁有确实的疏失。
另外，有关陈云林是否会称呼马英九为马主席，以及台湾政府是否会在陈云林所到之处拆除国旗，刘兆玄都予以否认。
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