台湾总统陈水扁表示，入返联公投的举办与过关比选总统还重要。他呼吁选民不要放弃公投，以免被国际嘲笑。分析人士认为，陈水扁在入联公投的议题上面临强大压力，担心入联公投如果失败将影响台湾加入联合国的机会，也伤害他总统任期的历史定位。
根据台湾中央社报导，台湾总统陈水扁最近表示，总统票可以不投给谢长廷，但是公投票一定要投。星期一，陈水扁在接受台湾一家电视媒体专访时再度强调，公投的举办和过关要比选总统更为重要，因为入联、返联公投都是向全世界发声，照顾台湾比照顾政党还要重要。
陈水扁还表示，在2004年他竞选连任时就说过，宁愿总统没选上，但是公投的推动绝对要进行，如果因为这样导致总统连任失败也没关系。
*施正锋：因为陈水扁面临强大压力*
由于批评人士普遍认为民进党是要利用入联公投绑大选，以提高民进党的总统选情，陈水扁的说法似乎与此不相符合。
台湾东华大学原住民民族学院院长施正锋在接受美国之音海峡论谈节目访问时表示，陈水扁面临强大压力，才会采取以公投举办为主，为谢长廷催票在其次的策略。
他说：“因为他已经没有连任总统的压力，但是如果入返联公投不管是哪个案子或者两个案子都没有过，我想他的历史罪名会很大，因为民进党在他的总统任内，把公投用作一个工具性催票的操弄，使得我们加入联合国的契机跑掉了，甚至相当负面的影响，我想他是担心这一点。”
施正锋表示，前总统李登辉以及台联党提出公投脱离大选，延后举行公投的主张，使民进党政府以及陈水扁面临极大压力，在不能将入联议题搞砸的困境下，民进党只好接受国民党的返联公投，并一再呼吁选民参与公投。
*伍维婷：公投不是选择蓝绿*
而民进党美东党部执行长伍维婷则否认民进党对公投和总统选举有主要和次要的分别。
伍维婷说：“民进党长久以来就坚持要深化民主，公民投票就是深化民主的进程。在总统大选中，我们认为这是中国与台湾的对决，我们希望台湾派的总统能够胜选，所以在总统大选方面我们还是非常努力的。”
伍维婷也指出，台湾上一次的公民投票就是由于严重的蓝绿对立而失败，所以陈水扁总统才会提出公投过关比选总统重要。
伍维婷说：“所以总统这样讲就是希望大家不要把公民投票视为在政治上要选蓝还选绿的表态，公民投票应该是人民对国家重大事件、议题的表态。这次不管是民进党的入联公投还是国民党的返联公投，它针对的是台湾人民对于加入联合国这件事我们的态度是什么。”
*巫和怡：国民党须谨慎行事*
曾经担任国民党国大代表的巫和怡博士在美国之音海峡论谈节目中表示，国民党的返联公投比较务实，国际社会对返联公投的反应也不像对入联公投那样激烈，他相信如果返联公投通过，影响会比较小。
不过巫和怡也承认，如果国民党在选前最后时刻决定要拒领公投票抵制公投，很可能会影响国民党候选人马英九的总统选情，国民党必须三思而行。
