台湾以北京企图矮化台湾为由拒绝奥运圣火经过台湾，引发各界争议。台湾宣布不接受奥运火炬通过台北的路线安排。这个决定开创了奥运会历史上奥运会员拒绝奥运圣火经过的先例。
中华奥委会和行政院体委会星期四晚10点联合宣布，拒绝国际奥委会和北京奥组委的火炬传递路线安排，说北京“矮化台湾地位的企图至为明显”，因此台湾无法接受。
蔡辰威说：“此一路线为中国国内行进路线，恐有矮化我主权的企图，这是我方所无法接受的。”
*蔡辰威：最后是政府决定*
蔡辰威接受美国之音的访问时说：“当然这个最后决定是政府决定的，不是中华奥委会的决定。... ...我想政府有这样的决定，应该也会有一个评估吧。 ”
台湾批评中国方面经常使用“中国台北”的字眼，矮化台湾，并称在奥运圣火的路线安排上，台湾“明显察觉中国将会宣传”为中国国内路线。不过蔡辰威表示，在两岸奥委会的长期工作接触中，他没有过被矮化的感受。
蔡辰威说：“在中国奥委会和我们的书信来往或是平常的称呼，我倒是没有听过 ‘中国台北’这四个字。”
*凸显主权独立国家理念*
台湾媒体说，去年11月和今年3月，台海两岸奥委会负责人对圣火传递的路线进行了沟通，台湾要求的从第三国进或者从第三国出的条件获得满足，双方为此还签订协议。
台湾总统陈水扁周五就政府拒绝奥运火炬通过台湾的决定公开表示，一定要坚持从第三国进、从第四国出，凸显台湾是主权独立的国家这个理念。
陈水扁说：“体委会和中华奥委会都已经对外进行了说明，决定之后，相关的部门才作反映。之前大家的共识就是不能矮化台湾，我们作为一个主权国家。”
*民进党支持决定*
很多民进党立法委员都支持当局的决定，认为台湾不应该在这个情况下委屈，忍辱含垢。
立委赖清德说：“对这种政治圣火以及体育一中我们坚持反对的立场。”
*国民党表示遗憾*
对民进党政府的决定，国民党发言人苏俊宝立即作出书面回应，声明国民党对此感到非常遗憾。他强调，目前的2008年北京奥运圣火路线存在各自表述的空间，很难让人与矮化台湾有太多的联想，并批评民进党政府“没有必要自外于全球体坛，自我孤立”。
*马英九：没有自信的表示*
前国民党主席马英九星期五说：“民进党越来越坚持深绿的路线，我个人基本上认为这是一种没有自信的表示，会使国际社会感到挫遏，对我们其实是不利的。”
*一民众：不要卡到政治问题*
台北一位民众对美国之音表示，参与奥运是大家的期盼，对不能亲眼看到奥运圣火经过台湾感到遗憾。他说：“依我所知道的话，大家都欢迎圣火进来。不要卡到政治问题应该都好啦，因为台湾卡到这种政治问题太乱了，乱到我们生意也难做。”
