台湾在野党国民党的主席马英九因首长特别费遭到起诉而宣布辞去党主席以及参选总统。对此，台湾政坛出现了相当多不同的反应。
针对马英九遭到起诉并宣布将参选2008年总统，台湾总统陈水扁星期一以感触良深来表达看法。陈水扁强调，他会继续惕厉和省思。
有关国营事业正名的议题，陈水扁表示，马英九曾经表示国民党2008年重新执政之后，一定会再改回来，他为此感到忧心。陈水扁认为，马英九说出这种话令人不可思议。
*吕秀莲：所有首长特别费都应查*
外界认为，民进党政治人物的首长特别费也应该一并追查。台湾副总统吕秀莲表示，如果首长特别费要查的话，就应该全台湾的官员一起查，包括历任正副总统、五院院长、甚至立法委员，都应该一起查个清楚。
民进党立法院党团召开记者会批评，马英九说要化悲愤为力量参选总统是掩耳盗铃的作法。民进党呼吁，马英九应该面对现实，不要把人民选票当成个人的遮羞布和漂白剂。
民进党立委王幸男表示，现在距离正式登记2008年总统选举，大约还有一年的时间，只要在这段时间马英九被判刑，他就将丧失参选总统的资格。
民进党立委林国庆还嘲讽，国民党有意修改党纲当中的排黑条款，以便让马英九仍然能代表国民党参选总统，根本是走回头路的作法。他说：“把排黑条款重新修改，那表示你(国民党)是纳黑喽，国民党要重新启动黑金的政党运作。”
为了因应马英九宣布参选总统，民进党也提前了总统初选的时程。民进党中常会星期三决议，3月将开放初选登记，5月决定总统参选人的名单。
*国民党：起诉马乃政治迫害*
不过，国民党立委赖仕葆解释说，修改排黑条款并不是只为了马英九所量身订作，也是为了接下来的立委和地方选举。
他说：“马英九已经辞掉党主席，所以事实上，党中央做的任何决定，认真讲起来，和他的关系并不大。第二，昨天提案的蔡正元委员主要着眼于马上立委的初选到了，我算过，最少10个以上的政务官加上地方的首长都有特别费的问题。”
*马英九支持度上升*
国民党立法院党团还表示，许多媒体最新的民意调查都显示，马英九被起诉之后，支持度反而上升了10个百分点，显示这项起诉是政治迫害。党团书记长徐少萍指出，马英九参选总统是全民的期盼，国民党一定会协调出一组人马夺回政权，不辜负人民的期待。
亲民党立法院党团也表示全力支持国民党的一切作为，并呼吁国亲沟通平台应该尽速启动。亲民党立委刘文雄还说，危机就是转机，对蓝军来说，马英九被起诉未尝不是好事。
