台湾县市长选举结束之后，国民党主席马英九和副总统吕秀莲都对于这次选举的结果发表了看法。
台湾在野的国民党获得了县市长选举压倒性的胜利之后，党主席马英九星期天接受中视专访时被问到这次选举是否如同外界所说的是对陈水扁总统的不信任投票。马英九说：“陈总统他自己参与的这么深，他就不可能再切割了嘛！道理很简单，他的一切是非都会影响到选民的观感，这点他跑也跑不掉，如果他没有出来助选的话，说不定(民进党)结果还好一点。”
马英九还说，高雄捷运舞弊案件的关系人、前总统府副秘书长陈哲男是陈水扁总统身边的人，选民怎么可能听陈水扁讲话时忘了陈哲男这回事呢？马英九甚至认为，陈水扁总统应该负起责任。他说，陈总统如果出面道歉或是认错，对选后蓝绿阵营的和解、修补关系，甚至对陈总统本人都有帮助。
*马英九：陈水扁不必为败选辞职*
不过，马英九也强调，虽然陈水扁总统应该负起责任，但是从制度面来看，陈水扁不必为败选辞职，事实上也不适合辞职，因为毕竟这是一次地方性的选举。
马英九表示，行政院长谢长廷和民进党主席苏贞昌等人都承认失败，愿意彻底改革，他对此予以肯定。马英九说，打选战不是把对方消灭或打扁，应该在分出胜负之后，记取教训，继续努力，才会促成良性的竞争。
*吕秀莲：失败是成功的本钱*
另一方面，台湾副总统吕秀莲出席一项“选举改革研讨会”时，除了对马英九表示祝贺之外，也推崇民进党主席苏贞昌为败选请辞的民主风范。 吕秀莲在选前就表示，国民党这次选举会赢，当时还引发了党内的不满。
吕秀莲直言，她和陈水扁总统都应该为败选负责。她说：“我和陈水扁总统要概括承受这次选举的结果，但是如果输掉一次的选举而让国家赢得更大的民主胜利，基本上我还是觉得，我们看到进步就好。”
吕秀莲还表示，民进党这次虽然失败，却也是成功的本钱。她说，民进党在1996年选举惨败，却赢得1997年桃园县长的补选、1997 年县市长选举获得13席，实现了地方包围中央，进而赢得2000年总统大选。吕秀莲指出，陈水扁1998年竞选台北市长连任失利，才转而投入2000 年总统大选并获胜，因此，民进党将积极检讨，并迎接未来台北和高雄市长的选举和立法委员的选举。
*扁祝贺选举顺利完成*
选举结束之后，陈水扁总统发表了新闻稿，不过内容只字未提民进党败选一事，仅指出对于选举能顺利完成，感到欣慰。他强调，选举激情已过，不论当选与否，大家都应该携手投入地方建设，为台湾人民的更高福祉而努力。
