آژانس بین‌المللی انرژی اتمی تایید کرد یکی از سالن‌های تولید سانتریفیوژ در سایت هسته‌ای اصفهان در جریان حملات اخیر مورد اصابت قرار گرفته است. این اعلام چند ساعت پس از آن صورت گرفت که ارتش اسرائیل از هدف قرار دادن مجدد این مجموعه در حملات شبانه خود خبر داد.
رافائل گروسی، مدیرکل آژانس، با اشاره به این رویداد گفت این سالن فاقد مواد هسته‌ای بوده و هیچ نشانه‌ای از نشت تشعشعات رادیواکتیو گزارش نشده است. او تأکید کرد که آژانس این تأسیسات را به‌خوبی می‌شناسد.
پیش‌تر ارتش اسرائیل اعلام کرده بود که در نخستین دور حملات خود در روز ۲۳ خرداد نیز تأسیسات اصفهان را هدف قرار داده است؛ سایتی که به‌گفته مقام‌های اسرائیلی، بخشی از زنجیره تولید اورانیوم در مسیر برنامه هسته‌ای ایران به‌شمار می‌رود. در بیانیه ارتش آمده بود که مرکز تولید سانتریفیوژ در مجتمع اصفهان نیز از اهداف حملات اخیر بوده است.
مدیرکل آژانس بین‌المللی انرژی اتمی روز جمعه ۳۰ خرداد در گزارشی به شورای امنیت سازمان ملل اعلام کرد که با وجود حمله به چهار بخش از تأسیسات هسته‌ای اصفهان، تاکنون تشعشعی در خارج از این مجموعه ثبت نشده است.
رافائل گروسی در بخش دیگری از گزارش خود هشدار داد که هرگونه آسیب به نیروگاه بوشهر می‌تواند پیامدهای خطرناکی در پی داشته باشد. او همچنین نسبت به احتمال ایجاد خطر در صورت وارد شدن آسیب به یکی از مراکز تحقیقاتی هسته‌ای در تهران هشدار داد.