Kontrole će započeti 16. septembra i u početku će trajati šest mjeseci, priopćeno je iz MUP-a.
"Jačamo unutarnju sigurnost i nastavljamo s našom tvrdom linijom protiv neregularnih migracija", rekla je ministrica unutarnjih poslova Nancy Faeser.
Njemačka je posljednjih godina učvrstila svoje stajalište o migracijama, dok se vlada trudi ponovno preuzeti inicijativu nakon što je oko tog pitanja porasla podrška krajnje desnoj Alternativi za Njemačku (AfD).
Nedavni smrtonosni napadi nožem u kojima su osumnjičeni bili tražitelji azila potaknuli su zabrinutost oko imigracije. Grupa Islamska država preuzela je odgovornost za napad nožem u zapadnom gradu Solingenu u kojem su u avgustu ubijene tri osobe.
AfD je ranije ovog mjeseca postala prva krajnje desna stranka od Drugog svjetskog rata koja je pobijedila na državnim izborima u Tiringiji.
Najava dolazi samo dvije sedmice uoči izbora u Brandenburgu gdje se kancelar Olaf Scholz i Faeserovi socijaldemokrati lijevog centra (SPD) bore za zadržavanje kontrole nad vladom.
Uvođenje privremenih graničnih kontrola mogao bi biti još jedan test evropskog jedinstva.
Njemačka dijeli svoju kopnenu granicu dugu više od 3700 km s Danskom, Nizozemskom, Belgijom, Luksemburgom, Francuskom, Švicarskom, Austrijom, Češkom i Poljskom.
Austrijski ministar unutarnjih poslova Gerhard Karner rekao je u ponedjeljak za list Bild da njegova zemlja neće primiti migrante koje Njemačka odbije na granici.
“Tu nema manevarskog prostora”, rekao je.
"To je zakon. Naložio sam šefu savezne policije da ne dopusti povratak", dodao je.
Njemačka je prošle godine najavila strože kontrole na kopnenim granicama s Poljskom, Češkom i Švicarskom kao odgovor na nagli porast broja onih koji prvi put podnose zahtjeve za azil.